Mississippi-floden er hjemsted for en række akvatiske planter og dyr i et komplekst, sammenkoblet økosystem. Akvatiske planter leverer mad og husly til mange forskellige arter i floden og kan være så små som encellede alger. Mississippi-floden har en række dyr, fra hvirvelløse dyr til fisk, frøer og andre.
Alger danner grønlige lag og kan farve vand.Alger
Ifølge Iowa Department of Natural Resources er Mississippi vært for to hovedtyper af alger: grøn og blå-grøn. Grønalger er den basale biologiske komponent i ethvert sundt økosystem; de skaber store kolonier, der kan give vandet en grønlig rollebesætning. Blågrønne alger er mindre ønskelige og betragtes som gener for gener. De er forbundet med stressede økosystemer og kan forårsage ubehagelige smag i fisk eller dræbe hele populationer.
Andemad
Denne almindelige frie flydende plante har et eneste lille blad og rødder, der dingler i vandet for at suge op næringsstoffer. Som antydet med dens navn er ænder en vigtig fødekilde for mange vandfugle.
Vandliljer
Hvide vandliljer er et almindeligt sted i Mississippi-floden og består af store, flydende blade med en læderagtig struktur. De producerer store hvide blomster oven på bladene og er rodfæstet i mudderet nedenfor.
Krebs
Disse krebsdyr, der også kaldes languster eller crawdads, ligner små hummer. De er primært bundfodere og forbruger løv fra andre dyr, æg og små dyr. Både indfødt og invasiv kræft lever i Mississippi-floden.
Malle
Kanal havkat er et almindeligt syn i Mississippi-floden. De er den mest talrige type havkat. Disse fisk kan vokse til overraskende størrelser og klæber primært til flodbunden. De er bemærkelsesværdige for deres tendens til at slå mange forskellige slags agn, men de bør sjældent spises på grund af faren for forurening af PCB (polychloreret biphenyl).
Leopard Frog
Disse plettede frøer kaldes også engfrøer. De bor i og omkring Mississippi-floden. De tjener ofte som en miljøindikatorart på grund af deres modtagelighed for forurenende stoffer og forurenende stoffer. De tilbringer det meste af deres tid langs margenerne af vandløb og andre vandmasser og spiser mest insekter, leddyr og andre hvirvelløse dyr.
